破産申立に反対している株主がいます。どうすればよいですか？

法人が破産を申し立てるに当たっては、意思決定機関である取締役全員の同意（取締役会設置会社においては取締役会の決議）が必要ですが、株主の同意は必要ありません。
株主が反対していても、破産申立は可能です。

ただ、株主に対して丁寧な説明をして理解を得ることが望ましいでしょう。